Fältprosten är placerad inom försvarsmaktens insatsstab. På högkvarteret finns en stabspastor som ansvarar för själavården för personalen vid högkvarteret och försvarsmaktens logistik.

Fältprosten ansvarar för bland annat utvecklingen av den militära själavården, han rekryterar och utbildar försvarsmaktens prästerliga och diakonala personal och deltar i internationella överläggningar. 

Fältprosten samverkar med stiften, andra trossamfund, MSB (Myndigheten för samhällsskydd och försvar), Sveriges kristna råd, Vårsta diakoni och SST (Nämnden för statens stöd till trossamfund). Försvarsmaktens regionala kontor svarar för kontakt med civila myndigheter och organisationer, exempelvis begravningsfrågor.

Militärpastorer finns på de 33 utbildningsförbanden, dessutom finns 40 hemvärnspastorer. I krigsorganisationen finns avsevärt fler fältpastorer än i hemvärnet och dessutom ett antal kontigentpastorer (utomlands).