Runt 10 000 soldater är utspridda över landet för att höja säkerheten kring kyrkor och moskéer och för att hjälpa till i polisens sökande efter personer som misstänks för påskhelgens dödliga attacker.
Muslimer över landet har efter dåden lämnat sina hem och samlats i flyktingläger av rädsla för hämndattacker och de uppmanas nu stanna hemma under fredagsbönen.
Kardinalen Malcolm Ranjith uppmanar också präster att inte hålla några mässor i kyrkor i väntan på nya besked från landets myndigheter.
- Säkerheten är viktig, säger Malcolm Ranjith.
USA och Australien uppmanar också sina medborgare i landet att undvika religiösa platser efter säkerhetstjänstens uttalande.
President Maithripala Sirisena uppger i ett uttalande under fredagen att Sri Lanka har förmågan att hantera säkerhetssituationen de kommande dagarna.
253 personer dog och över 500 skadades i flera sprängdåd mot kyrkor och hotell under påskhelgen. Dödstalet som rapporterades vara 359 skrevs i torsdags ned med över 100 personer. 76 personer har fängslats efter bombdåden.
Enligt Sirisena söker polisen efter ytterligare 140 personer med kopplingar till terrorrörelsen IS.